基于已知的基因组序列和注释信息，以新一代高通量转录组测序（RNA-Seq）数据作为输入，根据测序数据与参考基因组的序列比对，识别新的转录位点（新基因）、新的可变剪接事件，并对新旧基因进行结构分析、表达定量和差异表达分析。测序数据质量评估；测序数据与所选参考基因组的序列比对；确定外显子/内含子的边界，分析基因可变剪接情况；发掘未注释的基因区和新的转录本；识别转录区的SNP位点；修正已注释的5’和3’端基因边界；定量基因和转录本表达水平，识别不同样品（组）之间显著差异表达的基因并对其进行功能注释和富集分析。 测序数据量为6Gb的6个小鼠样品分析耗时约5天。
分析平台介绍
有参转录组测序分析平台可以进行标准分析和个性化分析，其中标准分析包括：差异表达基因分析、基因结构分析、新基因分析等。设定参数后点击提交进行分析，分析完成后在流程定制页面下生成标准化结题报告，实现一键式生成。
