可视化生信分析平台

系统

模块

功能说明

备注

平台操作系统

文件系统

用于兼容硬件层不同的文件系统

必选

计算系统

用于计算任务的调度和生命周期管理

计算系统管理平台

底层任务和集群的监控和管理，用于监控和管理集群中任务的运行状况，管理集群状况

管理员系统

用户管理

添加、删除用户，修改用户信息

权限管理

为不同用户设置可以使用的功能权限

项目管理

用于进行项目推送、数据推送，查看推送队列

用户系统

用户系统

用户注册、登陆、认证系统，用户信息管理

站内信

管理用户的站内信，用于接收通知等内容

数据管理系统

我的数据

图形化的数据管理系统，包含公共数据和个人数据，支持页面或ftp上传数据

项目管理系统

我的项目

将项目进展、任务、数据、报告统一放到项目中进行管理

我的任务

监控和处理运行的任务和历史任务

分析系统

分析平台

可选择分析平台包含：
真核生物有参考基因组的转录组分析平台；
真核生物无参考基因组的转录组分析平台；
小RNA测序分析平台；
circRNA测序分析平台（只有标准分析）；
长链非编码RNA测序分析平台；
全转录组联合分析平台（只有标准分析）；
有参全长转录组（ONT）分析平台（只有标准分析）；
蛋白质组分析平台；
代谢组分析平台；
微生物多样性分析平台；
全基因组重测序分析平台；
外显子组测序分析平台；
ChIP-Seq分析平台（只有标准分析）。

必选1个
选择真核有参，则必须配套购买参考基因组数据库

绘图工具

目前可绘制：热图、韦恩图、柱图、饼图、箱线图、散点图、点线图、面积图，特点：1.调整图片样式（以最佳方式展示数据的分布）；2.交互查看（点击图片相应区域，查看对应数据）。

可选

FASTA工具

FASTA工具集是一款针对FASTA格式序列的综合性处理软件。包括FASTA序列提取、过滤、长度分布图绘制、格式转换、统计等一系列功能。

可选

表格工具

表格工具可对用户的各种表格文件进行方便快捷的操作，可以实现表格行列名编辑、表格排序、表格筛选、表格合并的功能。

可选

工具

搭配标准分析完成更多个性化分析，100+款涵盖：绘图、质控、数据提取、序列分析、比对、统计、遗传进化、基因分析、组装、ncRNA等。

可选
也可以只购买部分工具

数据库系统

参考基因组数据库

共汇总了975个物种的861个基因组信息，其中138个物种包含190个参考基因组序列信息。

可选

功能基因数据库

功能基因数据库收录了25个数据库的近1700万条基因的相关信息，可通过功能关键词或基因ID进行检索。

项目管理高通量测序数据库

收录的SRA项目超过9万，样品超过360万，实验信息超过260万。

文献数据库

与Pubmed同步，增加了过滤栏，可以针对性查找，简化文章检索后期筛选过程，节省宝贵时间，可一键保存相关数据。

定制化数据库

整合基因组学、转录组学、蛋白组学、代谢组学等多组学数据，呈现给其他人查看和使用。

培训

线上培训

部署后远程培训1次（带考试），时长2小时内。
用户加微信/QQ群进行后续使用交流。

送1次线上培训

线下培训（线上培训后执行）

现场培训（包含讲师差旅住宿），报价为按天收费。
培训内容1：平台使用培训。包括现场演示，课后答疑，上机操作。
培训内容2：平台管理员培训。
培训内容3：使用平台必要的生信知识培训。

送1次为期2天的线下培训

更新

参考基因组数据库更新

添加可用于APP分析的新的物种或新版本的参考基因组数据

可免费部署10个额外版本的参考基因组

系统功能的更新

已部署功能升级到最新版，包含：平台操作系统、管理员系统、用户系统、数据管理系统、项目系统、已购买分析系统

交付后2年内免费更新1次

维护

软件系统维护

1、维护内容：系统使用问题解决、任务异常问题解决、集群调整及搬迁，保证系统正常使用；
2、服务时间：法定工作日*8小时；
3、响应时间：服务时间内响应时间为1小时；服务时间外响应时间8小时。
报价包含必要的上门维修费用。

交付后1年内免费维护

计算资源调整

增减或者调整计算节点。按照每台每次操作进行收费。

可选

名称

详细配置

数量

管理/存储节点

2U机架式服务器，支持2CPU
具体配置如下：
   – 2个银牌4110 CPU（8核/16线程, 2.1GHz, 9.6GT/s, 11MB Cache）
   – 8根16GB RDIMM 2666MT/s服务器内存
   – 4块600G 10K RPM SAS 12Gbps 2.5英寸企业级硬盘
   – 12块8T 7.2K RPM NLSAS 12Gbps 3.5英寸企业级硬盘，实际可用80T
   – Broadcom 5720 QP 1Gb 网络子卡
   – 2个750W服务器电源
   – 硬件远程访问控制器
   – 3年4小时上门服务（7*24*4）

1

计算节点

1U机架式服务器，支持2CPU
具体配置如下：
   – 2个金牌5120 CPU（14核/28线程, 2.2GHz, 10.4GT/s, 19.25MB Cache），共28核
   – 8根32GB RDIMM 2666MT/s服务器内存，共256G内存
   – 1块600G 10K RPM SAS 12Gbps 2.5英寸企业级硬盘
   – Broadcom 5720 QP 1Gb 网络子卡
   – 2个750W服务器电源
   – 硬件远程访问控制器
   – 3年4小时上门服务（7*24*4）

2

交换机

1U机架式以太网交换机
具体配置如下：
   – 24个1Gb 网络接口
   – 2个10GbE SFP+ 光纤接口
   – 3年4小时上门服务（7*24*4）

1

机柜

1 × 19″ 42U 600*1000 标准机柜
2路PDU
   – 32A工业连接器输入
   – 12口10A万用插口输出

1