利用简化测序对大豆进化关系及重要农艺性状的基因定位研究

Domestication footprints anchor genomic regions of agronomic importance in soybeans.

• PMID：26479264
• 杂志：The New phytologist
• 影响因子：7.672

研究背景：

分为两个重点，一是国内外材料在驯化路径上的一个验证，野生，驯化和半驯化的关系；二是国内材料驯化的路径及方向，半驯化群体向北向南分别驯化为完全驯化群体；

研究目的：

对大豆进化关系及重要农艺性状的基因定位

材料方法：

材料：大豆，一共3个群体，完全驯化群体FD（404株），半驯化群体SD（36株）和野生型群体ND（72株），其中，其他国家的材料占（42株），我们国家的材料占（470株），

材料和方法：一共3个群体，完全驯化群体FD（404株），半驯化群体SD（36株）和野生型群体ND（72株），其中，其他国家的材料占（42株），我们国家的材料占（470株）

SLAF简化测序

技术路线：

实验结果：

1）基于SNP，用EIGENSOFT软件，进行主成分分析（Principal components analysis-PCA），得到512个大豆样品的主成分聚类情况。不同的颜色代表不同的群体，每个点代表一个样本，相同颜色的聚到了一起，说明遗传背景比较接近。图中结果展示FD、ND和SD三个群体各自聚类；进化树的结果与PCA一致。