全基因组重测序分析平台

全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的全基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。基因组重测序方向是生物信息学中比较重要的一个分支,已经广泛应用到了农学、医学等领域,并对育种和靶向治疗起到了极具意义的指导作用。高通量测序技术出现后,重测序数据出现了指数型增长,海量数据的产生给生物信息学带来了极大的挑战。百迈客重测序分析平台为快速、高效、准确的完成数据分析,挖掘数据中的科学意义,提供了一条捷径。其常规分析内容包括:测序数据质量评估,序列比对,SNP、InDel、SV、CNV等变异检测和注释,变异所在基因的功能注释等;在此基础上还可以进行深入挖掘,包括:SNP分析、InDel分析、突变基因分析、Circos制图、基因引物设计。

分析平台介绍

基本分析:只需要选择原始测序数据和参考基因组,一键提交即可完成常规的重测序分析内容,包括:测序数据质量评估,序列比对,SNP、InDel、SV、CNV等变异检测和注释,变异所在基因的功能注释等。流程分析用时因参考基因组大小、样品数目、测序数据量等而异,200M的参考基因组,4个样品,测序深度平均为20X(4G/样品),分析耗时约24h。