分析平台

让数据挖掘轻而易举

立即体验

标准化生信分析

分析平台集成了一系列生信分析软件，并将其无缝串联起来，形成一套标准化的分析流程，在标准分析中您可以根据研究需要自由定义各步骤的主要参数，如参考基因组、差异分组、差异基因筛选标准等。目前百迈客私有云包含了业内常用NGS分析流程，从原始数据开始，只需轻松几步，即可获得内容丰富的标准化分析报告，是传统科技服务模式的替代品。

简单几步完成任务投递

在线查看结题报告

多样的个性化功能，助力数据二次挖掘！

个性化分析是在标准分析结果的基础上，进行更深入的二次挖掘，或者做一些更高级的分析，得到的结果可以直接用于文章发表；目前百迈客私有云包含丰富的个性化分析功能，可以覆盖用户大部分个性化分析需求。

个性化分析功能展示：参数设置

个性化分析功能展示：结果展示

个性化分析功能展示：图片交互

个性化分析应用场景举例：基因筛选

筛选特定功能的基因、筛选差异分组中的基因、筛选组间共有和特有的基因

个性化分析应用场景举例：共表达分析

WGCNA分析、 k-means聚类

个性化分析应用场景举例：蛋白互作网络分析、转录因子分析

分析平台列表

平台名称	类型	功能描述
真核有参转录组分析平台	RNA类	基于已知的基因组序列和注释信息，以RNA-Seq测序数据作为输入，通过序列比对，进行基因表达定量、可变剪切、差异分析、功能注释与富集、转录本SNP分析等。
真核无参转录组分析平台	RNA类	以RNA-Seq测序数据作为输入，从头（de novo）组装转录本，构建Unigene库，并对Unigene进行表达定量、差异分析、功能注释与富集、SSR鉴定、转录本SNP分析等。
小RNA测序分析平台	RNA类	以miRNA-Seq测序数据作为输入，分析内容包含：miRNA鉴定和预测、miRNA家族分析、miRNA表达定量和差异分析、样品相关性分析、靶基因预测及功能注释富集分析等。
长链非编码RNA测序分析平台	RNA类	分析内容包含了真核有参转录组分析平台的所有分析内容，且包含其特有分析内容：lncRNA预测、lncRNA靶基因预测、靶基因差异分析等。
全转录组联合分析平台	RNA类	以特定组织在某一时间所转录出的编码RNA（mRNA）和非编码RNA(lncRNA, circRNA, miRNA)整体作为研究对象，分析内容包含：不同RNA表达量计算及全局展示、差异表达RNA全局展示、共表达分析、竞争性内源RNA（ceRNA）分析、关键基因通路整合分析等。
有参全长转录组（ONT）分析平台	RNA类	该平台以Oxford Nanopore转录组测序数据作为输入，基于参考基因组序列进行分析，包含：数据质控、转录本结构分析（可变剪切、APA分析、CDS预测、转录因子预测等）、转录本和基因定量、差异分析、功能注释与富集分析、蛋白互作分析等。
蛋白质组分析平台	蛋白	结合高精度质谱仪分析的结果对蛋白质进行定量，分析内容包含：蛋白表达定量及差异分析、功能注释与富集分析、与mRNA进行联合分析等。
代谢组分析平台	代谢	基于色谱质谱等产生的数据，借助于统计学方法研究生物体内代谢物的变化状况，分析内容包含：代谢物定量及差异分析、OPLS-DA分析、与mRNA进行联合分析等。
微生物多样性分析平台	微生物	可以基于16S、18S、ITS、多种功能基因（AOA、nifH、pmoA等）序列完成微生物多样性分析，分析内容包含：OUT聚类、物种注释、Alpha多样性分析、Beta多样性分析、组间差异显著性分析、多元统计分析、16S功能基因预测分析、CCA分析等。
宏基因组分析平台	微生物	以NGS数据作为输入,数据质控后，基于测序reads进行宏基因组物种注释；将测序reads组装成contig序列；预测contig序列中的基因；对所有预测得到的基因去冗余，构建非冗余基因集；对非冗余基因基于多种数据库进行基因功能注释；基于宏基因组物种注释信息和基因功能信息进行差异分析、富集分析等统计比较。
全基因组重测序分析平台	DNA类	以WGS数据作为输入，分析内容包含：序列比对、SNP/InDel检测、circos绘图、功能注释与富集、引物设计、PCA和进化树分析等。
全基因组关联分析平台	DNA类	以突变检测结果vcf文件作为输入，完成以下分析：群体结构、亲缘关系、候选基因功能注释、显著位点LD block分析、突变位点引物设计等。
外显子组测序分析平台	DNA类	可以完成全外显子组的突变挖掘，并基于dbSNP利用vqsr模型过滤假阳性突变位点，提高真实突变检出率，利用ANNOVAR完成1k Genomes、dbSNP、SIFT、COSMIC70、ESP6500五大数据库的关联，同时完成了Polyphen2突变对蛋白功能影响评估。
ChIP-Seq分析平台	DNA类	染色质免共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation Assay，ChIP）是一种研究蛋白质与生物体细胞中DNA 相互作用的经典方法，本平台以高通量测序数据作为输入，通过比对基因组进行Peak calling，并且可通过对Peak区域关联基因进行功能注释和富集分析预测其参与的生物学通路，是研究蛋白质和DNA相互作用的有力工具。