真核生物无参考基因组的转录组分析平台

以新一代高通量转录组测序(RNA-Seq)数据作为输入,从头(de novo)组装转录本,构建转录组(Unigene库),并对Unigene进行功能鉴定,以及结构和表达量分析。 测序数据质量评估;转录组组装,转录本和Unigene组装长度统计;Unigene结构分析,包括CDS预测、SSR鉴定和SNP分析;Unigene功能注释分析;Unigene差异表达分析及差异表达Unigene的功能注释和富集分析。测序数据量为6Gb的6个植物样品分析耗时约7天。

分析平台介绍

真核生物无参考基因组的转录组分析平台可以进行标准分析和个性化分析,其中标准分析包括:转录本拼接、差异表达基因分析、基因结构分析等。设定参数后点击提交进行分析,分析完成后在流程定制页面下生成标准化结题报告,实现一键式生成。