棉花是世界上最重要的经济作物之一,在2018年5月8日中国农业科学院棉花研究所所长李付广研究员、武汉大学朱玉贤院士、中国农业科学院棉花研究所杜雄明研究员、中国农业科学院农业基因组研究所所长黄三文研究员、林涛博士与北京百迈客生物科技有限公司关于亚洲棉的合作成果发表在Nature Genetics上,论文题目为“Resequencing of 243 diploid cotton accessions based on an updated A genome identifies the genetic basis of key agronomic traits”。该研究以全新亚洲棉基因组为基础,增加遗传进化和GWAS研究,对棉的品质、产量、抗病等重要农艺性状进行研究。其中朱玉贤院士与李付广研究员为通讯作者,杜雄明研究员为第一作者。 以下为文献详细解读: 英文题目:Sequencing of 243 diploid cotton accessions based on an updated A genome identifies the genetic basis of key agronomic traits. 中文题目:以更新的亚洲棉A基因组为基础的243份二倍体棉花的重要农艺性状的研究 1. 摘要: 亚洲棉(Gossypium arboreum)和草棉(Gossypium herbaceum)的祖先是现代栽培异源四倍体棉花A亚基因组的供体。本研究中通过整合了不同的技术,提升了亚洲棉的基因组组装水平;同时对243株二倍体棉花(亚洲棉和草棉)进行全基因组重测序分析,绘制基因组变异图谱,并发现亚洲棉和草棉(A)与雷蒙德氏棉(D)同时进行了分化;单独的对亚洲棉分析表明亚洲棉起源于中国南部,随后被引入长江和黄河地区,大多数具有驯化相关特性的种质都经历了地理隔离;通过亚洲棉的全基因组关联分析(GWAS),鉴定了亚洲棉11个重要农艺性状的98个显著关联位点,GaKASIII的非同义替换(半胱氨酸/精氨酸替换)使得棉籽中的脂肪酸组成(C16:0和C16:1)发生了变化;棉花枯萎病抗性与GaGSTF9基因的表达激活相关。本研究对理解棉花A亚基因组的进化具有重要的意义。 2. 研究背景: 棉花是世界上最重要的商业作物之一,同时也是研究植物多倍化的有价值的资源。亚洲棉最可能在马达加斯加或印度河流域文明(巴基斯坦摩亨佐达罗)开始驯化,随后分散到非洲和亚洲一些地区。亚洲棉最初在1000多年前作为观赏植物引入中国。当地方的农业生态环境的适应和人类选择影响的过程中,中国的Gossypium arboreum形成了独特的地理种群,称之为“sinense...

今天,百迈客9周岁啦! 9年来,我们不断创新、持续发展…从几人的初创团队到如今500多名员工的庞大队伍;从简单的实验设施到如今国际领先的分子实验平台;从单一的科研、测序服务到如今多层次、多选择的高通量测序平台以及面向生物大数据分析的开放云平台。 9年来,我们硕果累累…先后在《Nature Genetics》、《Nature Communications》、《PNAS》、《Nature》、《Plant Cell》等国际顶级学术刊物发表论文上千篇,SCI物种论文达100多种,影响因子累计3000+,此外还拥有40余项专利和150余项软件著作,多项经营指标连续多年保持100%以上增长率。 一路走来,是各位新老朋友的信任与支持,坚定了我们陪伴您探索世界的信念!值此,百迈客9周年之际,感恩回馈新老朋友!即日起至6月30日,免费、优惠、折上折送不停! 扫下方二维码参与活动,更有幸运大转盘精美礼品哦~ 一等奖10名: 100元生信图书大礼包一个 二等奖30名:精品水杯一个 三等奖50名:便利贴粘贴板一个     [button size='medium' style='' text='立即免费申请' icon='' icon_color='' link='http://host.convertlab.com/page/2001404886074145149/5ccca19211d746f88faa3b6fce4ebc33' target='_self' color='' hover_color='' border_color='' hover_border_color='' background_color='' hover_background_color='' font_style='' font_weight='' text_align='' margin='']   百迈客与您一同 借助基因科技力量,为世界探索新可能!    ...

  俗话说的好,正月十五闹元宵 一年更比一年好!! 为了回馈广大科研工作者对百迈客公司的支持与信任,我公司特意推出“闹元宵·赢双礼·100个转录调控云次账号免费送暨100个全长转录组超值特惠”活动,名额仅限100名!先到先得,速来参加吧!! 大礼一:100个转录调控云次账号免费送 科技服务云时代,极速分析周期 百迈客云次账号,客户以次(G)为单位付费,在一定计算资源和固定APP 内自主完成1 次主流程分析及使用该项目APP长达 1 年的个性化分析,实现单次项目从建库测序到文章发表的一站式服务! 大礼二:100个全长转录组超值特惠 全长转录组首选百迈客,率先引进三代测序系统PacBio RSⅡ和PacBio Sequel,在样本处理与数据分析准确和全面性上远高于市场平均水平,目前已有兔子、甘薯、跳甲等多个成功案例,是国内三代综合实力最强的科技服务公司之一。【相关链接见文末】 本次活动规则: 1、中奖客户只需支付建库测序费用,即可尊享百迈客提供的建库测序+次账号信息分析(不限样本数,样本越多,免费越多)!中奖客户还可同时享受全长转录组超值特惠! 2、活动日期(赢双礼):2018年2月22日-2018年3月10日,逾期失效!! 3、两大礼有效日期:需在2018年3月31日前签单开票!! 4、参与方式:识别或扫下方二维码进行抽奖活动(百分百中奖)!! 活动详情可与当地销售联系 部分成功案例 【项目文章】三代测序构建兔子转录本图谱 【项目文章】三代全长比较转录组研究甘薯和野生甘薯的进化关系(文末有惊喜~) 【项目文章】一样的数据,不一样的文章~ 图片来自网络,侵删 百迈客云不仅是面向生物大数据分析的开放云平台,为用户提供包括生物信息分析APP、计算资源、公共数据、信息分析培训的整合服务,也是科研工作者的终生制项目管理一站式平台,相比传统线下科技服务,能随时随地在线检视项目全程进展(送样-提取检测-建库-测序-数据质控-分析-交付),国内首家实现云端全结果交付(结题报告和结果文件,个性化结果,提取检测报告)!选择百迈客云服务,让您省心无忧,实现科研论文的快速转化!...

弹指一挥间,2017年转眼就到了要跟大家告别的时刻,在上一期的年终大盘点中跟大家分享了百迈客云平台用户的傲人成绩,在累累硕果的背后,一直有着一群兢兢业业的生信人,这一年里,他们是根据广大用户的体验反馈,不断改进,不断更新,使咱们的云平台来了一场华丽丽的大变身。细数这一年,云平台总共更新53次,更新项目达200多个,包括新主流程的上线,页面版块的调整,分析功能的完善,数据库的改进,平台速度的提升等。每一次改进都是为了使云平台的用户有一个更好的分析体验,每一次更新都希望用户可以有更高效的科研产出。今天,咱们一起来瞅瞅百迈客云平台17年到底有哪些大变样。   2017全新上线篇 “让基因分析更简单”是百迈客云平台前进的不竭动力,相信大家最关心的应该是云平台这一年有哪些新的分析流程上线。 2017 4/14  云平台上线lncRNA v3.0主流程; 4/21  全基因组关联(GWAS)分析平台(Beta版,云服务个性化)正式上线; 6/9   BSA 分析平台 v1.0(Beta版,云服务个性化)正式上线; 9/22  全基因组重测序分析平台3.0正式上线。做lncRNA,GWAS,BSA,全基因组重测序分析的用户有福啦! 另外,早在2017年3月3日,咱们云平台的云组第一期已正式上线,实现了组内成员计算、存储、工具的资源共享等功能,一个课题组的成员们可以同时享用同一个分析平台,再也不用为互传数据和结果而烦忧; 2017年6月30日 ,移动端微信公众号全新改版,在百迈客云微信公众号中添加文献检索、文献解读、文献收藏、云账号绑定、项目进展查看和评价等功能,同期,在线支付功能上线,套餐用户支持使用支付宝、微信在线购买分析平台、小工具,收货地址与个人信息关联,用户可以在线填写发票信息。   APP主流程更新篇 这么多新的APP成功上线了,显然是一件值得庆贺的事情,无独有偶,咱们已经在线上的APP也从来没有停止前进的步伐。 2017 1/20  无参转录组分析APP进行了全面更新还实现了图片和基因之间的交互,新增“WGCNA”个性化工具,新增基因结构挖掘功能等功能; 3/3  微生物多样性分析APP更新至2.0版,新增6项分析内容;并且美化了流程中各步骤生成的图片,确保所有图形结果有png图和矢量图等功能; 3/17  微生物多样性分析APP再次更新:增加5个个性化分析内容;同期,小RNA测序分析APP也进行了20多项更新:增加小RNA所对应的染色体、起始点、终止点信息和miRNA对应的前体位置信息,支持更加精细化的检索,添加一键绘图等功能; 3/26  微生物多样性分析APP更新了引导教程图片; 6/16  微生物多样性分析APP进行了功能更新:基本分析和个性化中RDA/CCA环境因子支持文件上传,增加保存历史参数功能等; 7/7  ChIP-Seq 分析APP的基本分析,增加了Input/IP设置,且支持有生物学重复的差异分析等功能; 7/21  真核生物有参/无参分析APP个性化分析进行了更新:基因挖掘中相应添加eggNOG分类图、KEGG分类图、KEGG富集图、GO富集图、MA图和火山图等; 7/28  真核生物有参/无参分析APP个性化添加差异分组时增加Pvalue选项; 8/25  lncRNA分析APP进行了20多项的更新:新增图片交互功能,增加火山图、MA图,增加矢量图, Readme.pdf文件,WGCNA分析等; 9/1  微生物多样性分析APP个性化更新,增加21个个性化且每个个性化都有多个参数可以调整分析; 12/1  微生物多样性APP第四期更新:对OTU个数分布图、物种分布柱状图、PCA分析等15项进行了优化。   极速体验更新篇 为了方便用户能够在短时间内体验到云平台的标准分析和个性化分析内容,研发人员特意准备了极速体验项目,标准分析在两分钟内得到结题报告,随后即可进入个性化分析流程。 2017 3/31  有参、无参、表达谱,小RNA,四个分析平台更新了极速体验项目,增加示例数据; 6/30  群体三个分析平台(BSA、全基因组关联、基于第二代测序标记的遗传图谱)增加极速体验功能。目前已有极速体验的分析平台包括:真核生物有参转录组分析平台、真核生物无参转录组分析平台、小RNA测序分析平台、LncRNA测序分析平台、微生物多样性分析平台、数字基因表达谱分析平台、医学有参转录组分析平台、外显子组测序分析平台。 是不是要为咱们的研发人员打个call? 云课堂更新篇 百迈客云课堂,绝对是您科研路上的好帮手。2017年百迈客云课堂先后共进行了5次更新,现在的云课堂集185+线上培训课程于一体,囊括RNA系列、DNA系列、生物信息软件使用和大家讲坛等课程,针对分析平台每款APP都有详细说明及步骤提示,无论有没有生物信息学基础,都能帮助用户在短期内玩转各类分析。   数据库更新篇 整合利用公共数据发表论文是近年来的研究热点,2017年百迈客云平台数据库先后更新9次,包含8大数据库、12PB公共数据、373万样本,共收录826个参考基因组、2000+种医学数据、306万互作网络关系、1700万基因、8亿变异数据。   小工具更新篇 2017年云平台小工具先后更新了4次,包含PCA分析、WGCNA分析、转录因子预测、遗传共线性分析、GO富集分析、聚类热图、柱状图、点线图、miRNA基因家族分类等104款小工具和3大工具集,覆盖12大功能类别:基因分析、遗传进化、ncRNA、质控、组装、比对、数据提取、突变、统计、表格处理、绘图、序列分析等。   文献功能更新篇 2017年云平台对文献模块先后进行了3次更新,如今查找文献和数据导入都非常方便,共整合了2700+万篇文献,同步NCBI数据,设置多项过滤栏,方便快速查找,还可轻松获得全文解读,文章数据可一键导入分析。   云平台其他功能更新篇 2017 3/10 云平台建立项目进展查询机制,用户通过云平台可以及时了解项目进度,增加项目线上评价功能,用户可以在线对项目各个维度的服务进行评价,我们可以通过评价提升项目服务质量,以及对页面内容进行整理更新,使项目的管理更清晰; 4/10  云平台结题报告进行全面优化,包括加载速度和流畅度,右侧导航可以智能展开和收起,图片可调大,添加专有名词解释; 5/19  Venn图支持多个区域选择,WGCNA添加分类模块功能富集结果图的展示,转录因子支持动物物种的预测,有参支持按照指定基因名称替换; 5/26  云科技官网上线文献检索、功能基因数据库和学术课堂功能,不用登陆即可体验超强功能; 7/14  真核有参、小RNA测序、微生物多样性、ChIP-Seq分析平台增加pdf格式结题报告下载功能; 7/21  云平台登录支持第三方微信便捷登录; 9/22  为了用户在体验过程中的流畅度,在平台登录页面添加了浏览器使用建议。贴心无处不在~   告别成绩斐然的2017,迎来了充满希望的2018,我们坚信新的一年百迈客云平台(BMKCloud)一定会再创辉煌,为广大用户提供一个更加完美的数据分析平台。作为一个生物大数据分析的开放云平台,拥有庞大的专业用户群和开发者用户群(15000+),为用户提供完整的生物信息分析以及整合利用公共数据的解决方案,我们一直在努力!...

2017年12月2日,2017新疆植物学会、2017年学术年会、暨第三届植物学科研究生论坛在新疆农业大学顺利召开,百迈客作为独家赞助商,以新一代高通量测序技术领跑者的身份出席了此次学术会议。 会议主要围绕 “十九大报告中的生态文明建设——新疆植物学工作者的责任与挑战”这一主题,会议主要包括以下议题:1、植物多样性与生态系统服务功能 2、人类活动与气候变化对植物多样性的影响 3、植物种间相互作用与生态系统稳定性 4、干旱区重要植物类群系统演化与格局 5、干旱区植物抗逆的分子机理 6、中亚区域植物资源的分布及合理利用。本次会议旨在为新疆植物资源的利用与保护及生态环境的可持续发展献计献策。会上重点交流了新疆生态文明建设中植物科学相关领域在 2017 年取得的最新研究成果,介绍了国内外植物科学研究的最新动态,并对新疆植物科学未来的发展趋势进行了展望。 针对“植物多样性与生态系统服务功能”这一主要议题,百迈客公司周剑南博士在报告中指出,目前,很多新疆地区特有的植物还没有参考基因组,严重限制了对这些植物的研究和保护。 百迈客拥有新一代高通量测序技术的丰富经验,能够提供包含三代基因组,光学图谱,Hi-C,全长转录组,全转录组等技术在内的一揽子解决方案。这些新一代测序技术的应用,能显著提升新疆地区植物学研究的科研水平,保护新疆特有的种质资源和生态环境,为建设祖国的西北边疆做出贡献。...

年账号促销   标准版(33折): 1万(原价3万),并赠送500元购物卡(或1200元项目抵扣券);   专业版(5折): 3万(原价6万),并赠送1500元购物卡(或2400元项目抵扣券);   注:需在2017年12月31日前回全款方可享受以上优惠。 项目抵扣券需在2018年6月30日前使用,过期即自动失效。 连买2年及2年以上,赠送购物卡(或项目抵扣券)可累积叠加,如买2年专业版,即送4800元项目抵扣券。   预存款促销   预存款增值: 3W-10W增值10%;10W以上增值20%;   预存款返礼: 3W-10W返礼4%;10W以上返礼6.4%;20W以上再赠iphoneX;   预存款送产品: 3-5万,送标准版3个月;5-10万,送专业版3个月;5-10万,送标准版一年;>15万,专业版一年;   注:预存款,1-3只能选择其一,不能同时享用。 2017年回款方可享受以上优惠。 预存款转执行协议时,需按照当时市场正常价格执行,无其他折扣权限。...

金秋开学迎新季,百迈客微生物送好礼,为感恩长期支持百迈客的各位老师,百迈客微生物产品开学送好礼,微生物测序数据分析双升级,价格优惠至更低!     活动一、微生物多样性分析平台个性化内容升级至29项,深度解读微生物多样性数据,活动期间签单客户即赠多样性云平台一个月,另99元可再赠送一个月!   活动二、宏基因组数据升级,价格更低,全面丰富的宏基因组分析内容,基因水平深入挖掘环境微生物功能信息,助力微生物科学研究,优惠正在进行中!   活动三、细菌基因组测序,高深度三代测序,完整的细菌基因组0Gap组装,超低优惠价格,活动期间签单即送细菌完成图比较基因组分析!   活动四、百迈客微生物多样性信息分析免费培训班,加入百迈客多样性交流平台(QQ群439540040)即可免费参加定期培训,专业测序分析干货等你来拿!   更多优惠正在进行中,详细请咨询当地销售经理...

百迈客云平台(BMKCloud)自2015年10月正式商用以来已有15000+注册用户,运用百迈客云平台可视化小工具发表文章数已超过20余篇。为感恩回馈各位新老用户对百迈客云的支持与关注,百迈客云现推出72款生物信息分析小工具免费使用,希望在科研路上助您一臂之力! 72款小工具  聚类热图、PCA分析、GO/KEGG分类富集图、lncRNA分类及对应基因注释、遗传共线性分析、差异基因GO富集分析、柱状图、多平面(纵向)点线图绘制、miRNA基因家族分类、参考基因组reads统计分布图、关联区域分析、单因素曼哈顿图、绘图工具等。 12大功能类别 基因分析、 遗传进化、  ncRNA、 质控、 组装 、比对、 数据提取、 突变、 统计、 表格处理 、绘图 、序列分析等。 操作指南  登录百迈客云科技官网(http://www.biocloud.net/)——进入注册用户界面——填写注册信息——注册成功——领取云豆——使用小工具(您还可以根据需求多次调整绘图、统计结果) 云豆轻松get 注册完成即可获得200个云豆,完善个人信息获得200个云豆,邀请好友注册获得2000个云豆,签到获得50个云豆,每日首次登陆获得3个云豆,上传文献获得500个云豆,项目评价获得100个云豆。 生信科研学习平台 [button size='' style='' text='立即使用' icon='' icon_color='' link='https://international.biocloud.net/zh/software/tools/list' target='_self' color='' hover_color='' border_color='' hover_border_color='' background_color='' hover_background_color='' font_style='' font_weight='' text_align='' margin=''] ...

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