12月25 这一年,百迈客云平台的华丽丽丽丽大变身 ——做科研,我们是认真的
弹指一挥间,2017年转眼就到了要跟大家告别的时刻,在上一期的年终大盘点中跟大家分享了百迈客云平台用户的傲人成绩,在累累硕果的背后,一直有着一群兢兢业业的生信人,这一年里,他们是根据广大用户的体验反馈,不断改进,不断更新,使咱们的云平台来了一场华丽丽的大变身。细数这一年,云平台总共更新53次,更新项目达200多个,包括新主流程的上线,页面版块的调整,分析功能的完善,数据库的改进,平台速度的提升等。每一次改进都是为了使云平台的用户有一个更好的分析体验,每一次更新都希望用户可以有更高效的科研产出。今天,咱们一起来瞅瞅百迈客云平台17年到底有哪些大变样。
2017全新上线篇
“让基因分析更简单”是百迈客云平台前进的不竭动力,相信大家最关心的应该是云平台这一年有哪些新的分析流程上线。
2017
4/14 云平台上线lncRNA v3.0主流程;
4/21 全基因组关联(GWAS)分析平台(Beta版,云服务个性化)正式上线;
6/9 BSA 分析平台 v1.0(Beta版,云服务个性化)正式上线;
9/22 全基因组重测序分析平台3.0正式上线。做lncRNA,GWAS,BSA,全基因组重测序分析的用户有福啦!
另外,早在2017年3月3日,咱们云平台的云组第一期已正式上线,实现了组内成员计算、存储、工具的资源共享等功能,一个课题组的成员们可以同时享用同一个分析平台,再也不用为互传数据和结果而烦忧;
2017年6月30日 ,移动端微信公众号全新改版,在百迈客云微信公众号中添加文献检索、文献解读、文献收藏、云账号绑定、项目进展查看和评价等功能,同期,在线支付功能上线,套餐用户支持使用支付宝、微信在线购买分析平台、小工具,收货地址与个人信息关联,用户可以在线填写发票信息。
APP主流程更新篇
这么多新的APP成功上线了,显然是一件值得庆贺的事情,无独有偶,咱们已经在线上的APP也从来没有停止前进的步伐。
2017
1/20 无参转录组分析APP进行了全面更新还实现了图片和基因之间的交互,新增“WGCNA”个性化工具,新增基因结构挖掘功能等功能;
3/3 微生物多样性分析APP更新至2.0版,新增6项分析内容;并且美化了流程中各步骤生成的图片,确保所有图形结果有png图和矢量图等功能;
3/17 微生物多样性分析APP再次更新:增加5个个性化分析内容;同期,小RNA测序分析APP也进行了20多项更新:增加小RNA所对应的染色体、起始点、终止点信息和miRNA对应的前体位置信息,支持更加精细化的检索,添加一键绘图等功能;
3/26 微生物多样性分析APP更新了引导教程图片;
6/16 微生物多样性分析APP进行了功能更新:基本分析和个性化中RDA/CCA环境因子支持文件上传,增加保存历史参数功能等;
7/7 ChIP-Seq 分析APP的基本分析,增加了Input/IP设置,且支持有生物学重复的差异分析等功能;
7/21 真核生物有参/无参分析APP个性化分析进行了更新:基因挖掘中相应添加eggNOG分类图、KEGG分类图、KEGG富集图、GO富集图、MA图和火山图等;
7/28 真核生物有参/无参分析APP个性化添加差异分组时增加Pvalue选项;
8/25 lncRNA分析APP进行了20多项的更新:新增图片交互功能,增加火山图、MA图,增加矢量图, Readme.pdf文件,WGCNA分析等;
9/1 微生物多样性分析APP个性化更新,增加21个个性化且每个个性化都有多个参数可以调整分析;
12/1 微生物多样性APP第四期更新:对OTU个数分布图、物种分布柱状图、PCA分析等15项进行了优化。
极速体验更新篇
为了方便用户能够在短时间内体验到云平台的标准分析和个性化分析内容,研发人员特意准备了极速体验项目,标准分析在两分钟内得到结题报告,随后即可进入个性化分析流程。
2017
3/31 有参、无参、表达谱,小RNA,四个分析平台更新了极速体验项目,增加示例数据;
6/30 群体三个分析平台(BSA、全基因组关联、基于第二代测序标记的遗传图谱)增加极速体验功能。目前已有极速体验的分析平台包括:真核生物有参转录组分析平台、真核生物无参转录组分析平台、小RNA测序分析平台、LncRNA测序分析平台、微生物多样性分析平台、数字基因表达谱分析平台、医学有参转录组分析平台、外显子组测序分析平台。
是不是要为咱们的研发人员打个call?
云课堂更新篇
百迈客云课堂,绝对是您科研路上的好帮手。2017年百迈客云课堂先后共进行了5次更新,现在的云课堂集185+线上培训课程于一体,囊括RNA系列、DNA系列、生物信息软件使用和大家讲坛等课程,针对分析平台每款APP都有详细说明及步骤提示,无论有没有生物信息学基础,都能帮助用户在短期内玩转各类分析。
数据库更新篇
整合利用公共数据发表论文是近年来的研究热点,2017年百迈客云平台数据库先后更新9次,包含8大数据库、12PB公共数据、373万样本,共收录826个参考基因组、2000+种医学数据、306万互作网络关系、1700万基因、8亿变异数据。
小工具更新篇
2017年云平台小工具先后更新了4次,包含PCA分析、WGCNA分析、转录因子预测、遗传共线性分析、GO富集分析、聚类热图、柱状图、点线图、miRNA基因家族分类等104款小工具和3大工具集,覆盖12大功能类别:基因分析、遗传进化、ncRNA、质控、组装、比对、数据提取、突变、统计、表格处理、绘图、序列分析等。
文献功能更新篇
2017年云平台对文献模块先后进行了3次更新,如今查找文献和数据导入都非常方便,共整合了2700+万篇文献,同步NCBI数据,设置多项过滤栏,方便快速查找,还可轻松获得全文解读,文章数据可一键导入分析。
云平台其他功能更新篇
2017
3/10 云平台建立项目进展查询机制,用户通过云平台可以及时了解项目进度,增加项目线上评价功能,用户可以在线对项目各个维度的服务进行评价,我们可以通过评价提升项目服务质量,以及对页面内容进行整理更新,使项目的管理更清晰;
4/10 云平台结题报告进行全面优化,包括加载速度和流畅度,右侧导航可以智能展开和收起,图片可调大,添加专有名词解释;
5/19 Venn图支持多个区域选择,WGCNA添加分类模块功能富集结果图的展示,转录因子支持动物物种的预测,有参支持按照指定基因名称替换;
5/26 云科技官网上线文献检索、功能基因数据库和学术课堂功能,不用登陆即可体验超强功能;
7/14 真核有参、小RNA测序、微生物多样性、ChIP-Seq分析平台增加pdf格式结题报告下载功能;
7/21 云平台登录支持第三方微信便捷登录;
9/22 为了用户在体验过程中的流畅度,在平台登录页面添加了浏览器使用建议。贴心无处不在~
告别成绩斐然的2017,迎来了充满希望的2018,我们坚信新的一年百迈客云平台(BMKCloud)一定会再创辉煌,为广大用户提供一个更加完美的数据分析平台。作为一个生物大数据分析的开放云平台,拥有庞大的专业用户群和开发者用户群(15000+),为用户提供完整的生物信息分析以及整合利用公共数据的解决方案,我们一直在努力!