动物研究百迈客云解决方案-BMKCloud_数据库收录的猪属数据所涉及研究方向

解决方案概述

 

针对动物基因组学研究,百迈客云可通过BMKCloud_数据库模块向用户提供海量的动物高通量测序公共数据,借助公共数据,可大幅降低研究成本,提升研究层次。数据检索、下载、保存均在图形化界面下完成,避免了传统模式中,须在命令行界面下进行数据下载、格式转换等一系列繁琐操作的限制,完全适用于国内生信0基础的用户。

对于公共数据的下游分析,百迈客云目前已实现公共数据模块与分析模块的无缝对接,用户可直接将已保存至用户目录的数据直接导入BMKCloud_APP分析模块进行下游分析,该模块同样采用图形化操作界面,无需用户掌握任何编程基础,高度集成化专业化的分析流程可保证用户快速完成对数据的基础分析以及必要的数据深度挖掘。

 

整合mRNA公共测序数据,构建猪肉品质相关miRNA-mRNA调控网络

 

方案实现过程

1)进入BMKCloud_数据库模块进行数据检索与保存。

2)进入BMKCloud_APP模块,简单5步完成公共数据or自测数据导入及任务投递。

3)分析结果自动生成,继续使用个性化分析模快速完成数据深度挖掘。

 

 

BMKCloud_数据库收录的猪属数据所涉及研究方向:

 

疾病类研究:猪多系统衰竭综合征、猪生殖呼吸道综合征、支气管哮喘、猪伪狂犬病、猪弓形虫病、全反式维甲酸&抗病、猪圆环病毒感染、鼠伤寒沙门菌感染、口蹄疫病毒感染、猪巨细胞病毒感染、脊髓损伤……

生长发育类研究:繁殖力、同胎生仔数、胚胎发育、猪卵巢发育、生长速度、猪肉品质、食欲、脂肪组织发育、肌肉组织发育、猪背最长肌分化……

其他:基因组组装、环境适应、遗传进化……

 

文章思路

Khan FA et al.   Analysis of Bos taurus and Sus scrofa X and Y chromosome transcriptome highlights reproductive driver genes.   Oncotarget. 2017

 

百迈客云实现方案

 

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