动物研究百迈客云解决方案-BMKCloud_数据库收录的牛属数据所涉及研究方向

解决方案概述

 

针对动物基因组学研究,百迈客云可通过BMKCloud_数据库模块向用户提供海量的动物高通量测序公共数据,借助公共数据,可大幅降低研究成本,提升研究层次。数据检索、下载、保存均在图形化界面下完成,避免了传统模式中,须在命令行界面下进行数据下载、格式转换等一系列繁琐操作的限制,完全适用于国内生信0基础的用户。

对于公共数据的下游分析,百迈客云目前已实现公共数据模块与分析模块的无缝对接,用户可直接将已保存至用户目录的数据直接导入BMKCloud_APP分析模块进行下游分析,该模块同样采用图形化操作界面,无需用户掌握任何编程基础,高度集成化专业化的分析流程可保证用户快速完成对数据的基础分析以及必要的数据深度挖掘。

 

整合mRNA公共测序数据,构建猪肉品质相关miRNA-mRNA调控网络

 

方案实现过程

1)进入BMKCloud_数据库模块进行数据检索与保存。

2)进入BMKCloud_APP模块,简单5步完成公共数据or自测数据导入及任务投递。

3)分析结果自动生成,继续使用个性化分析模快速完成数据深度挖掘。

 

 

BMKCloud_数据库收录的牛属数据所涉及研究方向:

 

疾病类研究:膀胱癌 、牛副结核病、牛病毒性腹泻、牛圆环病毒感染、牛支原体感染、牛疱疹病毒感染、裂谷热病毒感染、大肠杆菌感染、结核分枝杆菌感染、多形腺瘤基因(PLAG)功能研究、繁殖力低下……

生长发育类研究:繁殖力、发情周期、进食效率、牛奶产量&品质、牛背最长肌品质、牛肉品质、脂肪生成、胚胎发育、胃肠道发育、试管胚胎、隐性致死基因鉴定……

其他:基因组组装、环境适应、遗传进化……

 

文章思路

 Liu X et al. MicroRNA-mRNA regulatory networking fine-tunes the porcine muscle fiber type, muscular mitochondrial respiratory and metabolic enzyme activities. BMC Genomics. 2016

 

百迈客云实现方案

 

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